深圳北理莫斯科大学自2017年成立之初便确定设立经济系。经济系采用莫斯科大学（2021QS世界排名74位）经济系教学方案，以结合理论基础学习和专业实践能力培养为特色，旨在培养学生分析能力和创造性思维。

莫斯科大学经济系成立于1941年，是为俄罗斯培养经济学家和经营管理者的最主要的高等学府之一。莫斯科大学经济系以其完整的、独具特色的教学体系和理论学习结合实际运用的培养思想吸引着世界各地的优异学子，如今已经发展成为莫斯科大学学生人数最多的院系。此外，经济系拥有强大的师资力量，在409名全职教师和研究人员中，有94名教授及225名科学候选人。深圳北理莫斯科大学经济系采用莫斯科大学经济系2015年修改的最新的教学方案：其中着重指出加强基础学科的教学，通过导入阶段、过渡阶段到高级课程循序渐进的教学方法培养学生的数学分析能力和创造性思维。更重要的是，深圳北理莫斯科大学吸引了莫斯科大学教研带头人、知名教授、以及有丰富教学经验副教授，为本科学生争取到了最优良的教学资源。

自创立以来，深圳北理莫斯科大学经济系坚持“以学生为本，持续全面发展”的理念，以严谨的治学理念、优质的教学服务和开放的办学思想为指导，以培养基础扎实、思维活跃、能力突出的人才为目标不断地优化和发展。短短三年的时间里，形成了良好的学风和教风，并在2019年经济学综合博弈实验大赛中崭露头角。