依托莫斯科大学化学系，深圳北理莫斯科大学的化学系的本科《化学》专业于2022年开始招生。至2023年已招收56名本科生，其中中国籍本科生50名、留学生6名。
化学系于2023年开始招收《无机化学》硕士研究生；2024年开始同时招收《无机化学》、《放射化学》两个方向的硕士研究生。2024年开始同时招收《物理化学》、《放射化学》、《分析化学》三个方向的博士研究生。
莫斯科大学化学系具有丰富的自然科学、精密科学和人文学科教学经验以及高水平科研经验，深圳北理莫斯科大学化学系与其协同开展入才培养、科学研究等教学工作。
深圳北理莫斯科大学化学系为学生的实践课程及科学研究配备了国际先进的科研设备与实验室等条件。化学系持续优化外文版课程材料，深圳北理莫斯科大学图书馆为化学系购置了先进的专业电子数据库与丰富的图书资料，为专业人才培养奠定了良好的基础。
